Pri upgrade drupalu je nutné dodržiavať všetky kroky v súbore UPGRADE.txt pribalenom v balíčku s drupalom (zálohovať, vypnúť site, povypínať moduly, nastaviť základnú tému pred upgrade, reverzne po upgrade).

Okrem toho je nutné do nového adresárového stromu nakopírovať adresár /themes/niltheme, ktorý obsahuje tému portálu NIL a súbor /misc/favicon.ico, ktorý obsahuje ikonku pre prehliadače.

Ak je upgradnutý modul fckeditor, je nutné súbory samotného fckeditora (ktoré sa sťahujú osobitne) nakopírovať do adresára nového modulu (zvyčajne /sites/all/modules/fckeditor/fckeditor).